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磁盘I/O性能优化的几个思路
[工作效率] · fall · 发布于 · 2020-07-05 · 787 次点击 · 复制地址

倔强青铜Ⅲ   fall  · 2020-07-05 22:04:04 · 显示全部楼层 · 阅读
虽然 I/O 的性能指标很多,相应的性能分析工具也有好几个,但理解了各种指标的含义后,你就会发现它们其实都有一定的关联。

顺着这些关系往下理解,你就会发现,掌握这些常用的瓶颈分析思路,其实并不难。

找出了 I/O 的性能瓶颈后,下一步要做的就是优化了,也就是如何以最快的速度完成 I/O操作,或者换个思路,减少甚至避免磁盘的 I/O 操作。

本文,我就来说说,优化 I/O 性能问题的思路和注意事项。
I/O基准测试

按照我的习惯,优化之前,我会先问自己, I/O 性能优化的目标是什么?换句话说,我们观察的这些 I/O 性能指标(比如 IOPS、吞吐量、延迟等),要达到多少才合适呢?

事实上,I/O 性能指标的具体标准,每个人估计会有不同的答案,因为我们每个人的应用场景、使用的文件系统和物理磁盘等,都有可能不一样。

为了更客观合理地评估优化效果,我们首先应该对磁盘和文件系统进行基准测试,得到文件系统或者磁盘 I/O 的极限性能。

fio(Flexible I/O Tester)正是最常用的文件系统和磁盘 I/O 性能基准测试工具。它提供了大量的可定制化选项,可以用来测试,裸盘或者文件系统在各种场景下的 I/O 性能,包括了不同块大小、不同 I/O 引擎以及是否使用缓存等场景。

fio 的安装比较简单,你可以执行下面的命令来安装它:
# Ubuntu
apt-get install -y fio
# CentOS
yum install -y fio

安装完成后,就可以执行 man fio 查询它的使用方法。

fio 的选项非常多, 我会通过几个常见场景的测试方法,介绍一些最常用的选项。这些常见场景包括随机读、随机写、顺序读以及顺序写等,你可以执行下面这些命令来测试:
#随机读
fio -name=randread -direct=1 -iodepth=64 -rw=randread -ioengine=libaio -bs=4k -size=1G
#随机写
fio -name=randwrite -direct=1 -iodepth=64 -rw=randwrite -ioengine=libaio -bs=4k -size=1G
#顺序读
fio -name=read -direct=1 -iodepth=64 -rw=read -ioengine=libaio -bs=4k -size=1G -numjobs=
#顺序写
fio -name=write -direct=1 -iodepth=64 -rw=write -ioengine=libaio -bs=4k -size=1G -numjob

在这其中,有几个参数需要你重点关注一下。

    direct,表示是否跳过系统缓存。上面示例中,我设置的 1 ,就表示跳过系统缓存。
    iodepth,表示使用异步 I/O(asynchronous I/O,简称 AIO)时,同时发出的 I/O 请求上限。在上面的示例中,我设置的是 64。
    rw,表示 I/O 模式。我的示例中, read/write 分别表示顺序读 / 写,而randread/randwrite 则分别表示随机读 / 写。
    ioengine,表示 I/O 引擎,它支持同步(sync)、异步(libaio)、内存映射(mmap)、网络(net)等各种 I/O 引擎。上面示例中,我设置的 libaio 表示使用异步I/O。
    bs,表示 I/O 的大小。示例中,我设置成了 4K(这也是默认值)。
    filename,表示文件路径,当然,它可以是磁盘路径(测试磁盘性能),也可以是文件路径(测试文件系统性能)。示例中,我把它设置成了磁盘 /dev/sdb。不过注意,用磁盘路径测试写,会破坏这个磁盘中的文件系统,所以在使用前,你一定要事先做好数据备份。

下面就是我使用 fio 测试顺序读的一个报告示例。
read: (g=0): rw=read, bs=(R) 4096B-4096B, (W) 4096B-4096B, (T) 4096B-4096B, ioengine=libfio-3.1
Starting 1 process
Jobs: 1 (f=1): [R(1)][100.0%][r=16.7MiB/s,w=0KiB/s][r=4280,w=0 IOPS][eta 00m:00s]
read: (groupid=0, jobs=1): err= 0: pid=17966: Sun Dec 30 08:31:48 2018
read: IOPS=4257, BW=16.6MiB/s (17.4MB/s)(1024MiB/61568msec)
slat (usec): min=2, max=2566, avg= 4.29, stdev=21.76
clat (usec): min=228, max=407360, avg=15024.30, stdev=20524.39
lat (usec): min=243, max=407363, avg=15029.12, stdev=20524.26
clat percentiles (usec):
|  1.00th=[   498],  5.00th=[  1020], 10.00th=[  1319], 20.00th=[  1713],
| 30.00th=[  1991], 40.00th=[  2212], 50.00th=[  2540], 60.00th=[  2933],
  | 70.00th=[  5407], 80.00th=[ 44303], 90.00th=[ 45351], 95.00th=[ 45876],
| 99.00th=[ 46924], 99.50th=[ 46924], 99.90th=[ 48497], 99.95th=[ 49021],
| 99.99th=[404751]
bw (  KiB/s): min= 8208, max=18832, per=99.85%, avg=17005.35, stdev=998.94, samples=1iops        : min= 2052, max= 4708, avg=4251.30, stdev=249.74, samples=123
lat (usec)   : 250=0.01%, 500=1.03%, 750=1.69%, 1000=2.07%
lat (msec)   : 2=25.64%, 4=37.58%, 10=2.08%, 20=0.02%, 50=29.86%
lat (msec)   : 100=0.01%, 500=0.02%
cpu          : usr=1.02%, sys=2.97%, ctx=33312, majf=0, minf=75
IO depths    : 1=0.1%, 2=0.1%, 4=0.1%, 8=0.1%, 16=0.1%, 32=0.1%, >=64=100.0%
submit    : 0=0.0%, 4=100.0%, 8=0.0%, 16=0.0%, 32=0.0%, 64=0.0%, >=64=0.0%
complete  : 0=0.0%, 4=100.0%, 8=0.0%, 16=0.0%, 32=0.0%, 64=0.1%, >=64=0.0%
issued rwt: total=262144,0,0, short=0,0,0, dropped=0,0,0
latency   : target=0, window=0, percentile=100.00%, depth=64
Run status group 0 (all jobs):
READ: bw=16.6MiB/s (17.4MB/s), 16.6MiB/s-16.6MiB/s (17.4MB/s-17.4MB/s), io=1024MiB (1
Disk stats (read/write):
sdb: ios=261897/0, merge=0/0, ticks=3912108/0, in_queue=3474336, util=90.09%

这个报告中,需要我们重点关注的是, slat、clat、lat ,以及 bw 和 iops 这几行。

先来看刚刚提到的前三个参数。事实上,slat、clat、lat 都是指 I/O 延迟(latency)。不同之处在于:

    slat ,是指从 I/O 提交到实际执行 I/O 的时长(Submission latency);
    clat ,是指从 I/O 提交到 I/O 完成的时长(Completion latency);
    而 lat ,指的是从 fio 创建 I/O 到 I/O 完成的总时长。

这里需要注意的是,对同步 I/O 来说,由于 I/O 提交和 I/O 完成是一个动作,所以 slat 实际上就是 I/O 完成的时间,而 clat 是 0。而从示例可以看到,使用异步 I/O(libaio)时,lat 近似等于 slat + clat 之和。

再来看 bw ,它代表吞吐量。在我上面的示例中,你可以看到,平均吞吐量大约是 16MB(17005 KiB/1024)。

最后的 iops ,其实就是每秒 I/O 的次数,上面示例中的平均 IOPS 为 4250。

通常情况下,应用程序的 I/O 都是读写并行的,而且每次的 I/O 大小也不一定相同。所以,刚刚说的这几种场景,并不能精确模拟应用程序的 I/O 模式。那怎么才能精确模拟应用程序的 I/O 模式呢?

幸运的是,fio 支持 I/O 的重放。借助前面提到过的 blktrace,再配合上 fio,就可以实现对应用程序 I/O 模式的基准测试。你需要先用 blktrace ,记录磁盘设备的 I/O 访问情况;然后使用 fio ,重放 blktrace 的记录。

比如你可以运行下面的命令来操作:
#使用blktrace跟踪磁盘I/O,注意指定应用程序正在操作的磁盘
$ blktrace /dev/sdb
#查看blktrace记录的结果
# ls
sdb.blktrace.0  sdb.blktrace.1
#将结果转化为二进制文件
$ blkparse sdb -d sdb.bin
#使用fio重放日志
$ fio --name=replay --filename=/dev/sdb --direct=1 --read_iolog=sdb.bin

这样,我们就通过 blktrace+fio 的组合使用,得到了应用程序 I/O 模式的基准测试报告。
I/O性能优化

得到 I/O 基准测试报告后,再用上我们上一节总结的性能分析套路,找出 I/O 的性能瓶颈并优化,就是水到渠成的事情了。当然,想要优化 I/O 性能,肯定离不开 linux 系统的I/O 栈图的思路辅助。你可以结合下面的 I/O 栈图再回顾一下。
21105806-cbacffa822dafb95.png
下面,我就带你从应用程序、文件系统以及磁盘角度,分别看看 I/O 性能优化的基本思路。
应用程序优化

首先,我们来看一下,从应用程序的角度有哪些优化 I/O 的思路。

应用程序处于整个 I/O 栈的最上端,它可以通过系统调用,来调整 I/O 模式(如顺序还是随机、同步还是异步), 同时,它也是 I/O 数据的最终来源。在我看来,可以有这么几种方式来优化应用程序的 I/O 性能。

第一,可以用追加写代替随机写,减少寻址开销,加快 I/O 写的速度。

第二,可以借助缓存 I/O ,充分利用系统缓存,降低实际 I/O 的次数。

第三,可以在应用程序内部构建自己的缓存,或者用 Redis 这类外部缓存系统。这样,一方面,能在应用程序内部,控制缓存的数据和生命周期;另一方面,也能降低其他应用程序使用缓存对自身的影响。

比如,在前面的 MySQL 案例中,我们已经见识过,只是因为一个干扰应用清理了系统缓存,就会导致 MySQL 查询有数百倍的性能差距(0.1s vs 15s)。

再如, C 标准库提供的 fopen、fread 等库函数,都会利用标准库的缓存,减少磁盘的操作。而你直接使用 open、read 等系统调用时,就只能利用操作系统提供的页缓存和缓冲区等,而没有库函数的缓存可用。

第四,在需要频繁读写同一块磁盘空间时,可以用 mmap 代替 read/write,减少内存的拷贝次数。

第五,在需要同步写的场景中,尽量将写请求合并,而不是让每个请求都同步写入磁盘,即可以用 fsync() 取代 O_SYNC。

第六,在多个应用程序共享相同磁盘时,为了保证 I/O 不被某个应用完全占用,推荐你使用 cgroups 的 I/O 子系统,来限制进程 / 进程组的 IOPS 以及吞吐量。

最后,在使用 CFQ 调度器时,可以用 ionice 来调整进程的 I/O 调度优先级,特别是提高核心应用的 I/O 优先级。ionice 支持三个优先级类:Idle、Best-effort 和 Realtime。其中, Best-effort 和 Realtime 还分别支持 0-7 的级别,数值越小,则表示优先级别越高。
文件系统优化

应用程序访问普通文件时,实际是由文件系统间接负责,文件在磁盘中的读写。所以,跟文件系统中相关的也有很多优化 I/O 性能的方式。

第一,你可以根据实际负载场景的不同,选择最适合的文件系统。比如 Ubuntu 默认使用ext4 文件系统,而 CentOS 7 默认使用 xfs 文件系统。

相比于 ext4 ,xfs 支持更大的磁盘分区和更大的文件数量,如 xfs 支持大于 16TB 的磁盘。但是 xfs 文件系统的缺点在于无法收缩,而 ext4 则可以。

第二,在选好文件系统后,还可以进一步优化文件系统的配置选项,包括文件系统的特性(如 ext_attr、dir_index)、日志模式(如 journal、ordered、writeback)、挂载选项(如 noatime)等等。

比如,使用 tune2fs 这个工具,可以调整文件系统的特性(tune2fs 也常用来查看文件系统超级块的内容)。 而通过 /etc/fstab ,或者 mount 命令行参数,我们可以调整文件系统的日志模式和挂载选项等。

第三,可以优化文件系统的缓存。

比如,你可以优化 pdflush 脏页的刷新频率(比如设置 dirty_expire_centisecs 和dirty_writeback_centisecs)以及脏页的限额(比如调整 dirty_background_ratio 和dirty_ratio 等)。

再如,你还可以优化内核回收目录项缓存和索引节点缓存的倾向,即调整vfs_cache_pressure(/proc/sys/vm/vfs_cache_pressure,默认值 100),数值越大,就表示越容易回收。

最后,在不需要持久化时,你还可以用内存文件系统tmpfs,以获得更好的 I/O 性能 。tmpfs 把数据直接保存在内存中,而不是磁盘中。比如 /dev/shm/ ,就是大多数 Linux 默认配置的一个内存文件系统,它的大小默认为总内存的一半。
磁盘优化

数据的持久化存储,最终还是要落到具体的物理磁盘中,同时,磁盘也是整个 I/O 栈的最底层。从磁盘角度出发,自然也有很多有效的性能优化方法。

第一,最简单有效的优化方法,就是换用性能更好的磁盘,比如用 SSD 替代 HDD。

第二,我们可以使用 RAID ,把多块磁盘组合成一个逻辑磁盘,构成冗余独立磁盘阵列。这样做既可以提高数据的可靠性,又可以提升数据的访问性能。

第三,针对磁盘和应用程序 I/O 模式的特征,我们可以选择最适合的 I/O 调度算法。比方说,SSD 和虚拟机中的磁盘,通常用的是 noop 调度算法。而数据库应用,我更推荐使用deadline 算法。

第四,我们可以对应用程序的数据,进行磁盘级别的隔离。比如,我们可以为日志、数据库等 I/O 压力比较重的应用,配置单独的磁盘。

第五,在顺序读比较多的场景中,我们可以增大磁盘的预读数据,比如,你可以通过下面两种方法,调整 /dev/sdb 的预读大小。

    调整内核选项 /sys/block/sdb/queue/read_ahead_kb,默认大小是 128 KB,单位为KB。
    使用 blockdev 工具设置,比如 blockdev --setra 8192 /dev/sdb,注意这里的单位是512B(0.5KB),所以它的数值总是 read_ahead_kb 的两倍。

第六,我们可以优化内核块设备 I/O 的选项。比如,可以调整磁盘队列的长度/sys/block/sdb/queue/nr_requests,适当增大队列长度,可以提升磁盘的吞吐量(当然也会导致 I/O 延迟增大)。

最后,要注意,磁盘本身出现硬件错误,也会导致 I/O 性能急剧下降,所以发现磁盘性能急剧下降时,你还需要确认,磁盘本身是不是出现了硬件错误。

比如,你可以查看 dmesg 中是否有硬件 I/O 故障的日志。还可以使用 badblocks、smartctl 等工具,检测磁盘的硬件问题,或用 e2fsck 等来检测文件系统的错误。如果发现问题,你可以使用 fsck 等工具来修复。
总结

本文,我们一起梳理了常见的文件系统和磁盘 I/O 的性能优化思路和方法。发现 I/O 性能问题后,不要急于动手优化,而要先找出最重要的、可以最大程度提升性能的问题,然后再从 I/O 栈的不同层入手,考虑具体的优化方法。

记住,磁盘和文件系统的 I/O ,通常是整个系统中最慢的一个模块。所以,在优化 I/O 问题时,除了可以优化 I/O 的执行流程,还可以借助更快的内存、网络、CPU 等,减少 I/O调用。

比如,你可以充分利用系统提供的 Buffer、Cache ,或是应用程序内部缓存, 再或者Redis 这类的外部缓存系统。



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